自然化河流建設(shè)的原則主要在于趨向自然的前提下創(chuàng)造豐富的環(huán)境條件，例如將河岸線設(shè)計成不規(guī)則型，彰顯結(jié)構(gòu)多樣性；盡量順應(yīng)自然，例如分區(qū)域分階段的治理河道，盡量利用自然動力進行治理，宜沖則沖，宜彎則彎；建設(shè)綠化網(wǎng)絡(luò)，河流是較為孤立的生態(tài)系統(tǒng)，應(yīng)將水和綠化網(wǎng)絡(luò)化，以豐富和穩(wěn)定生物物種；構(gòu)造簡潔的河流景觀，盡量采用自然的植被石材，讓建設(shè)的河流形態(tài)盡可能的接近原生態(tài)。

為了確保內(nèi)河航道在運行環(huán)節(jié)中不受到影響和破壞，往往會在航道的周圍采用相應(yīng)的護岸手段，傳統(tǒng)的工作就是借助砌塊石和鋼筋混凝土等進行覆蓋，雖然這種方式可以為航道整體的穩(wěn)定性提供的保障，但是仍然不能滿足對內(nèi)河航道的基本生態(tài)要求，嚴重的甚至還將對河流的生態(tài)系統(tǒng)造成影響，對于自然環(huán)境的穩(wěn)定發(fā)展也將產(chǎn)生十分不利的影響。對于陸地和水進行交錯的內(nèi)河航道而言，當前采用傳統(tǒng)的保護方式已經(jīng)無法更好的實現(xiàn)水汽調(diào)節(jié)作用，不僅不能對地面徑流中所產(chǎn)生的沖擊進行降低，同時也無法實現(xiàn)對航道的有效防御。

在進行內(nèi)河航道的保護環(huán)節(jié)中，護岸工程可以將水岸周邊的穩(wěn)定性進行顯著提升，防止波浪和河水對岸坡的侵蝕，在此環(huán)節(jié)中，還將對周圍的農(nóng)田和周圍居民生命安全的保障。但是在近年來的實際建設(shè)和發(fā)展中，由于河道的變化逐漸增強，所以河流的侵蝕性也對岸坡上的植被造成了一定影響，甚至威脅了大量動植物的生存，雖然護岸工程的建設(shè)一定程度上對內(nèi)河航道產(chǎn)生了一定的保護作用，但是生態(tài)環(huán)境的問題也更為顯著，只有進行有效的護岸才能對動植物生存起到更有效的幫助，滿足生態(tài)環(huán)境的基本需求。所以我們應(yīng)該認識到內(nèi)河航道和生態(tài)環(huán)節(jié)之間的聯(lián)系也十分密切，但是當前在社會發(fā)展過程中更重視人與自然的協(xié)調(diào)發(fā)展，自然和自然之間的協(xié)調(diào)發(fā)展，總之，生態(tài)護岸對于國家發(fā)展有著不可忽視的重要作用。