全球每年產生大量廚房廢油，但由于來源分散，回收難度加大。據統(tǒng)計，原材料收集成本占生物燃料成本的70%-80%。然而，木本油料植物受季節(jié)影響，難以維持可持續(xù)供應。糧食原料存在著“人爭糧”、“人爭地”的問題?，F有油料作物不符合生長周期短、含油量高的特點。

進口原材料受天氣、國際市場變化等因素影響。今年以來日益的全球糧食危機對國際生物燃料產生了直接影響。生產工藝不成熟?，F有成熟工藝存在著燃料穩(wěn)定性不夠或潤滑性差等缺點。

目前，生物燃料用于世界各地的航空試飛。大多數生物燃料是按一定比例添加到傳統(tǒng)航空燃料中的。雖然世界上大多數航空公司進行的飛行試驗結果表明，生物燃料和傳統(tǒng)燃料的混合可以在不改變飛機發(fā)動機結構的情況下提高飛行效率，生物燃料是否足夠安全，以及它們是否會腐蝕或侵入發(fā)動機材料，但還需要進一步的討論和驗證。

產品成本高。以生物航空燃料為例，其成本是石油航空煤油的數倍，在成本上沒有競爭優(yōu)勢。雖然航空公司也會購買一定數量的生物航空燃料，但考慮到成本，購買量不會很大。此外，成品油的生產還將產生外部間接成本。

打破生物燃料現狀的途徑作為一種新興的能源生物燃料，現階段完全取代航空煤油是不現實的。歸根結底，使用哪種燃料取決于成本。因此，在技術不斷突破的前提下，如何建立完善的產業(yè)，大規(guī)模降低成本，是生物燃料發(fā)展的關鍵。

2012年航空公司的累計碳排放量不得超過基線的97%，2013年不得超過基線的95%。在排放制度實施初期，航空公司可以免費獲得一定比例的免費排放配額，但免費配額逐年減少，非免費配額需要通過有償拍賣獲得。