化石是資源，保護(hù)工作面臨諸多挑戰(zhàn)。自然風(fēng)化、人為破壞和非法采集都威脅著化石遺產(chǎn)。各國通過建立自然保護(hù)區(qū)、立法保護(hù)和公眾教育等措施應(yīng)對這些挑戰(zhàn)。例如，美國《古生物資源保護(hù)法》和中國《古生物化石保護(hù)條例》都為重要化石提供了法律保護(hù)。

化石在確定地質(zhì)年代方面具有的作用。標(biāo)準(zhǔn)化石是那些生存時間短、分布廣泛的物種，可以標(biāo)定地層年代。通過化石序列建立的生物地層學(xué)框架，是全球地質(zhì)年表的基礎(chǔ)。在演化生物學(xué)中，化石提供了一系列"快照"，展示不同地質(zhì)時期生物形態(tài)的變化，如從恐龍到鳥類的過渡化石，為進(jìn)化理論提供了直接的證據(jù)。

傳統(tǒng)化石研究方法包括野外采集、實(shí)驗(yàn)室處理和形態(tài)學(xué)分析。古生物學(xué)家通過系統(tǒng)的地層調(diào)查和化石采集，獲取研究標(biāo)本。在實(shí)驗(yàn)室中，化石需要經(jīng)過精心修理（去除圍巖）、加固和復(fù)原。比較解剖學(xué)方法通過對比化石與現(xiàn)生生物的形態(tài)特征，推斷其分類位置和生物學(xué)特性。