藍(lán)莓苗的根系沒(méi)有根毛。正因如此，藍(lán)莓根系的吸收能力比具有根毛的根系小得多。其吸收面積只有同樣大小具有根毛的小麥根系的1/10。藍(lán)莓的根系細(xì)，呈纖維狀，細(xì)根在分枝前直徑為50～75um。
值得注意的是，幾乎所有藍(lán)莓的細(xì)根都有內(nèi)生菌根的寄生，從而克服藍(lán)莓根系由于沒(méi) 有根毛造成的對(duì)水分及養(yǎng)分的吸收困難。近年來(lái)，眾多的研究已，菌根的寄生對(duì)藍(lán)莓生長(zhǎng)是有益的。
矮叢藍(lán)莓根系的主要部分是根狀莖。據(jù)估計(jì)，矮叢藍(lán)莓大約85%的莖組織為根狀莖。不定芽在根狀莖上萌發(fā)，并形成枝條。根狀莖一般為單軸形式，直徑3～6。根狀莖分枝頻繁，在地表下6～25深的土層內(nèi)形成緊密(穿插)的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。新發(fā)生的根狀莖一般為粉紅色，而老根狀莖為暗棕色并且木栓化。矮叢藍(lán)莓的根系分布在上層中的有機(jī)質(zhì)層。

藍(lán)莓苗中期(新根初始形成量形成)可適當(dāng)降低濕度，以60%～75%為宜，可促進(jìn)根系和新葉生長(zhǎng)；后期(根群形成后一出圃)對(duì)濕度要求不嚴(yán)格，50%-60%即可。此時(shí)根據(jù)長(zhǎng)勢(shì)及環(huán)境變化可適當(dāng)揭膜放風(fēng)，較低濕度有利于控制病害的發(fā)生。

合格的藍(lán)莓苗為：北高叢品種株高35-40cm，叢枝數(shù)2-4個(gè)，枝莖基部粗度為3-4mm；半高叢品種株高35cm，叢枝數(shù)3-4個(gè)，枝莖基部粗度3-4mm；植株生長(zhǎng)健壯，根系發(fā)達(dá)，充滿整個(gè)基質(zhì)空間，無(wú)病蟲(chóng)害，能田間定植成活。