部分破壞蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),使物質(zhì)組分之間實現(xiàn)分離,這在皮革、絲綢等含蛋白質(zhì)豐富的材料加工時十分有效,部分破壞蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),使物質(zhì)組分之間實現(xiàn)分離,這在皮革、絲綢等含蛋白質(zhì)豐富的材料加工時十分有效,

果膠酶是水果加工中重要的酶，應(yīng)用果膠酶處理破碎果實，可加速果汁過濾，促進澄清等。應(yīng)用其他的酶與果膠酶共同使用，其效果更加明顯，如秦藍等采用果膠酶和纖維素酶的復(fù)合酶系制取南瓜汁，大大提高了南瓜的出汁率和南瓜汁的穩(wěn)定性。

并通過掃描電子顯微鏡觀察南瓜果肉細胞的超微結(jié)構(gòu)，顯示出單一果膠酶制劑或纖維素酶制劑對南瓜果肉細胞壁的破壞作用遠不如復(fù)合酶系。又如張倩等提出了一種新型果蔬加工酶—粥化酶（含有果膠酶、纖維素酶、半纖維素酶及蛋白酶等），可提高果蔬果汁的出汁率，增加澄清度，在果蔬加工中有廣闊的應(yīng)用前景。