生物燃料的發(fā)展瓶頸盡管生物燃料已在世界各個(gè)領(lǐng)域得到應(yīng)用，但目前還沒(méi)有成為國(guó)際能源的主力軍。主要原因是以下限制。原材料來(lái)源不穩(wěn)定。由于多種原因，廚房廢油和木本油料作物作為原料來(lái)源不穩(wěn)定。

進(jìn)口原材料受天氣、國(guó)際市場(chǎng)變化等因素影響。今年以來(lái)日益的全球糧食危機(jī)對(duì)國(guó)際生物燃料產(chǎn)生了直接影響。生產(chǎn)工藝不成熟?，F(xiàn)有成熟工藝存在著燃料穩(wěn)定性不夠或潤(rùn)滑性差等缺點(diǎn)。

即所有轉(zhuǎn)化過(guò)程將不可避免地導(dǎo)致新的污染源，包括二氧化碳和其他污染物的排放；如果煉油后的廢渣，特別是煉油廢油的廢渣處理不當(dāng)，也會(huì)造成污染，治理污染的成本終會(huì)增加到成品油的價(jià)格中。

打破生物燃料現(xiàn)狀的途徑作為一種新興的能源生物燃料，現(xiàn)階段完全取代航空煤油是不現(xiàn)實(shí)的。歸根結(jié)底，使用哪種燃料取決于成本。因此，在技術(shù)不斷突破的前提下，如何建立完善的產(chǎn)業(yè)，大規(guī)模降低成本，是生物燃料發(fā)展的關(guān)鍵。

歐美國(guó)家對(duì)亞麻薺菜的種植和應(yīng)用進(jìn)行了探索。亞麻薺菜是一種古老的油料作物，生長(zhǎng)周期短（4個(gè)月），產(chǎn)油率高（30%–45%），化肥、農(nóng)藥、除草劑等投入量低，從中提取油，殘?jiān)庸こ娠暳稀Ｔ诟碑a(chǎn)品附加值的幫助下，生物燃料的高成本是不夠的，甚至整個(gè)產(chǎn)業(yè)鏈都扭虧為盈。

此外，可以制定政策，引導(dǎo)消費(fèi)者積極參與生物燃料的使用。歐盟航空公司開(kāi)發(fā)了碳排放交易系統(tǒng)，并為航空公司規(guī)定了碳排放配額。在該系統(tǒng)中，以2004年至2006年往返歐盟的航空公司的年平均碳排放量作為該航空公司的排放基線。

微藻作為光合的光合生物之一，能提供大量非食物可再生生物質(zhì)能，積累大量脂類(lèi)，并能生產(chǎn)生物燃料。某些產(chǎn)油微藻的脂肪酸總量可達(dá)干重的50%~90%。更重要的是，微藻含有豐富的生物活性物質(zhì)，可在制備生物燃料的同時(shí)進(jìn)行值的綜合利用，相對(duì)降低微藻采油成本。

20世紀(jì)70年代，美國(guó)能源部為了發(fā)展可持續(xù)能源，對(duì)微藻進(jìn)行了大規(guī)模的收集、篩選和鑒定，終獲得了300多種產(chǎn)油微藻，即脂類(lèi)占細(xì)胞干重20%以上的微藻。其中，小球藻微球菌的脂比高達(dá)68%。據(jù)估計(jì)，藻類(lèi)的年產(chǎn)油量可達(dá)到每公頃養(yǎng)殖面積15000至80000升。

然而，目前微藻生物柴油的生產(chǎn)成本仍然很高，這是制約其商業(yè)化生產(chǎn)的瓶頸。除了繼續(xù)開(kāi)發(fā)具有優(yōu)良產(chǎn)油性能的藻類(lèi)外，還實(shí)現(xiàn)微藻生產(chǎn)的綜合利用。例如，從微藻中獲得高附加值產(chǎn)品，如DHA、類(lèi)胡蘿卜素和活性多糖，并將廢棄海藻殘?jiān)米魉a(chǎn)養(yǎng)殖的誘餌。